El museo divide sus contenidos en tres apartados. El dedicado a la arqueología comprende desde el Paleolítico Inferior hasta comienzos de la Edad Media, con piezas de las distintas épocas: Neolítico y Megalitismo, Edad del Cobre, del Bronce y del Hierro, Roma y su epigrafía, y restos visigodos
Las salas de etnografía están formadas por diversos objetos de uso doméstico y fabricación rudimentaria, e indumentarias tradicionales.
La sección de Bellas Artes contiene obras medievales, modernas y contemporáneas, firmadas por El Greco, Picasso, Miró, Saura u Oteiza. Las hay del Museo del Prado (Lucas Jordán, Carducho, Esquivel...); del Obispado (tallas, pinturas y orfebrería religiosa); y de Diputación (Alberto Sánchez, Canogar, Saura, Vostell...).
