El juez Baltasar Garzón también investiga las actividades del Partido Comunista de las Tierras Vascas (EHAK), que cuenta con 9 diputados en el Parlamento vasco, donde es la cuarta fuerza. La investigación se inició tras una querella de la asociación Víctimas del Terrorismo y fue admitida por el juez Fernando Grande- Marlaska en el 2005 mientras sustituía a Garzón.

Grande-Marlaska imputó a siete miembros de este partido, pero las investigaciones no pudieron acreditar que ETA se hubiera hecho con el mando en esta fuerza. La fiscalía revisa el sumario antes de decidir si insta su ilegalización.