En un informe del 27 de octubre del 2003, el CNI avisaba de que la "visibilidad" de España en el mundo árabe crecía por la guerra de Irak. Y advertía de que las amenazas eran un "indicativo de la elevación considerable del nivel de riesgo en territorio nacional". En diciembre del 2003, el Instituto de Defensa noruego halló en internet un mensaje de Al Qaeda que apuntaba a España. El Instituto Elcano, centro de análisis español, tradujo el texto y lo aportó al juzgado. Haizam Amirah Fernández, experto del instituto comparecerá como testigo.

La cúpula policial de la era Aznar también ha sido solicitada como testigo por la fiscalía. Se trata del exdirector general de la Policía Agustín Díaz de Mera, el excomisario general de Información Jesús de la Morena y el exsubdirector general Pedro Díaz-Pintado.