El magistrado del Tribunal Supremo (TS) Luciano Varela acusa a Baltasar Garzón de haber ignorado "los principios esenciales de un Estado de derecho" por haber investigado los crímenes del franquismo. En su auto de apertura de juicio oral, el instructor también sostiene que el imputado pudo "causar un evidente perjuicio personal al Estado español" si hubiera perseguido a personas "liberadas de cualquier responsabilidad penal" tras la aprobación de la ley de amnistía de 1977.

El juez del tribunal sostiene también que el togado de la Audiencia Nacional quiso asumir "funciones de suplencia" de otros poderes del Estado que han legislado para reparar el daño a los familiares de la dictadura. Y añade que su decisión no afecta a la independencia judicial, ya que esta solo queda en entredicho si va en contra "del imperio de la ley". Garzón, dice, se "ha apartado notoriamente de la interpretación usual de la ley". Y le echa en cara que archivara la querella presentada en 1998 contra Santiago Carrillo por los crímenes de Paracuellos con argumentos que no aplicó para investigar al otro bando de la guerra civil. El magistrado del TS también ajusta cuentas con la fiscalía, que le ha pedido reiteradamente el archivo de la causa por falta de delito.