La deuda total de la Junta no ha variado en el trienio 2002-2004, y se mantiene en 782 millones de euros. Ya para el 2006 se anuncia un nuevo crédito de 60 millones para afrontar los 74 millones de euros de la primera anualidad del plan extraordinario de inversiones.

Esta deuda se mantuvo estable en el 2000 y 2001 en 632 millones de euros, pero experimentó un incremento del 24% al año siguiente coincidiendo con el hecho de que iba a entrar en vigor la Ley de Estabilidad Presupuestaria que impedía a las comunidades autónomas pedir más créditos si no amortizaban antes los que ya tenían.