Según los datos del Ministerio de Sanidad y Consumo, el Hospital de Mérida está acreditado para formar especialistas en análisis clínicos; cirugía general y del aparato digestivo; medicina interna; obstetricia y ginecología; otorrinolaringología; pediatría; y cirugía ortopédica y traumatología.

Además, uno de los centros de salud de la ciudad puede formar a residentes de medicina familiar y comunitaria.

Extremadura ofertará en la convocatoria MIR de este año un total de 134 plazas, 128 de ellas de medicina y 6 en enfermería obstétrico-ginecológica.