Por otro lado, ambos Gobiernos decidieron crear un nuevo modelo de cooperación bilateral a nivel político a través del establecimiento de un Consejo de Seguridad y Defensa. Sócrates dejó claro que este proyecto "no está definido en sus detalles" ni en sus plazos y que se tiene aún que desarrollar. En este sentido, el formato y las modalidades de funcionamiento serán definidas por las partes en los próximos meses con el fin de constituirlo en la próxima cumbre, aunque se aplicarán experiencias similares.

Tanto Rodríguez Zapatero como Sócrates destacaron la importancia de la puesta en marcha del centro de nanotecnología de Braga, que España y Portugal pretenden que se convierta en un referente mundial. El convenio firmado ayer establece los objetivos, actividades, estatuto jurídico, sede, condiciones para ser miembros y la posibilidad de admitir a asociados y colaboradores porque se establece que estará abierto a los Estados europeos y no europeos que deseen incorporarse al mismo. También se recogen cuestiones presupuestarias.