Las reacciones al contenido del Plan Director del Hospital San Sebastián no se hicieron esperar tras la presentación, que fueron inmediatas en las redes sociales entre los habituales en perfiles de grupos de debate relacionados con el patrimonio. A través de un comunicado se pronunció la Asociación Cívica Ciudad de Badajoz, que criticó la "agresividad" del plan y lamentó que "carece en absoluto del consenso que una actuación de este tipo debe conllevar de la población pacense", por lo que pidió a los ciudadanos que se informen sobre la historia del edificio y del proyecto que se va a realizar, puesto que "puede que estemos ante un nuevo atentado gravísimo contra el patrimonio". Por su parte, la formación UPyD tachó de "atentado patrimonial" la propuesta realizada por la diputación y tildó de "inconcebible" que piensen transformar gran parte del edificio en una galería comercial que "poco o nada tiene que ver con un mercado de abastos como han intentado vender".

Estas manifestaciones fueron rechazadas por los arquitectos responsables del plan director, que lo defienden como un "trabajo científico" desarrollado durante meses por expertos profesionales de la arquitectura y del patrimonio.