El Consorcio Sepei tendrá como órganos de gobierno al presidente, dos vicepresidentes, la Asamblea General, la Junta de Gobierno y al diputado del servicio de bomberos en la diputación. La presidencia será ejercida de forma rotatoria y por un año por el presidente de la diputación, el alcalde de Cáceres y el alcalde de Plasencia, por este orden. La Asamblea General será el órgano supremo del consorcio y tendrá carácter de corporación de derecho público. Estará facultada, entre otras cuestiones, para aprobar los presupuestos anuales, cuentas, operaciones de crédito y la memoria anual, de la que tendrá que dar cuenta a los ayuntamientos consorciados. A la Junta de Gobierno le corresponderá la aprobación de obras y servicios y las contrataciones de toda clase de carácter plurianual que no excedan de cuatro años y cuya primera anualidad no supere el 10% de los recursos ordinarios del año. Estará formada por el presidente del consorcio, dos vicepresidentes, el diputado del Sepei, dos concejales de Cáceres y Plasencia y uno por cada ayuntamiento adherido al consorcio.
