Los alcornocales y encinares acogen a la colonia de buitre negro más numerosa y densa del mundo, con más de 250 parejas. El águila imperial ibérica, especie catalogada en peligro de extinción, cuenta con 11 parejas reproductoras en el Parque y su área de influencia. El visitante queda sorprendido por los cantiles fluviales, roquedos donde nidifican numerosas especies como cigüeña negra, buitre leonado, alimoche, águila real, halcón peregrino, búho real y chova pelirroja.