Pese al preacuerdo firmado, el proceso de integración de las dos aerolíneas no será un camino de rosas. Además de remontar las pérdidas que sufren ambas, personal y solapamiento de rutas serán los escollos que pueden entorpecer la fusión. Clickair cuenta con una plantilla de 740 empleados, que se encargan de gestionar 150 vuelos diarios, con los que se realizan 18 rutas nacionales y 37 internacionales. En total, mueve a 3,2 millones de pasajeros.

Vueling lleva a cabo el mismo número de vuelos diarios, 150, aunque con cinco aviones menos (20 frente a 25). Su plantilla es bastante más elevada, 1.280 personas, pero transportan a 6,2 millones de pasajeros. Varias de las rutas se solapan. La nueva compañía resultante deberá racionalizar esa situación. La reestructuración será inevitable.