El III Plan Regional de Investigación, Desarrollo e Innovación Tecnológica 2005-2008, contará con un presupuesto de 208,6 millones de euros, lo que supone casi el doble que su predecesor y cuatro veces más que el primero.

El objetivo es incrementar el número de investigadores de los tres actuales por cada mil activos, a 3,5, y el gasto de la empresas en I+D en un 20% o 30%.

El plan consta de seis programas temáticos: biomedicina y salud, tecnologías agrarias y agroalimentarias, sociedad del conocimiento, medio ambiente y desarrollo sostenible, producción industrial y recursos naturales, y ciencias humanas y sociales.

También prevé cuatro programa horizontales, para equilibrar todo el sistema, de formación de recursos humanos, promoción general del conocimiento, articulación del sistema e innovación empresarial.