CCOO y FETE-UGT han criticado la falta de negociación de la Consejería de Educación con las organizaciones sindicales respecto a la modificación de horarios en los institutos de enseñanza secundaria. La Junta, por su parte, asegura en un comunicado que las instrucciones de 7 de julio "no imponen ningún cambio de horario, sino que se limitan a autorizar la supresión de los cinco minutos existentes entre clase y clase en aquellos institutos que así lo acuerde el Consejo Escolar". Esta medida tendría como objetivo "mantener mejor el orden dentro del centro".

Las Instrucciones del 7 de julio de la Secretaría General de Educación concretan la norma de carácter general a las que deben adecuarse los institutos y obligan a la modificación de los horarios dos meses después de iniciado el curso escolar, según los sindicatos. Por su parte, la Junta dice que si son del 7 de julio "no tiene sentido que los sindicatos digan que imponen un cambio de horario a los dos meses de comenzar el curso". En cuanto a la ausencia de diálogo, la consejería dice "que se mantienen todas las reuniones necesarias a través de los cauces legalmente establecidos".