La mayoría de los cristianos egipcios forman parte de la iglesia ortodoxa que no obedece a Roma, con la que rompió en el año 461. La comunidad copta, cuyos miembros no se consideran árabes sino descendientes de los faraones, representan entre el 8 y el 10% de la población egipcia. El guía espiritual es el papa Shenuda III. Los coptos dicen ser hijos de los primeros cristianos que evangelizó San Marcos, que murió martirizado en Alejandría en el año 63.