En diciembre del 2004, la delegada del Gobierno, Carmen Pereira, aseguraba que entre lo contemplado por Fomento y lo que llevaba el ADIF, el AVE extremeño contaría con una inversión de 452,9 millones de euros en el periodo 2005-2008. Pereira atribuía a "errores" de interpretación que se hablase de partidas muy inferiores. Sin embargo, en el proyecto presupuestario del 2006 --que recoge las inversiones desde el 2005 hasta el 2009-- puede verse que en el cuatrienio al que aludía la delegada del Gobierno la inversión prevista es de 287,6 millones. Del total, 275,3 millones corresponderían al ADIF y 12,3 al Ministerio de Fomento.

Respecto a los trazados, el alcalde de Mérida, Pedro Acedo, ha anunciado que solicitará una reunión con los responsables de Fomento par que le expliquen en qué estado se encuentra el proyecto del AVE a su paso por Mérida. Acedo indicó que después de un año desde que se presentaron las alegaciones, aún no sabe nada. El edil recordó que la principal, consensuada con la Junta, aludía la eliminación del ´by-pass´ en el acceso a Mérida, y la construcción de una entrada directa del AVE a la ciudad. Las alegaciones fueron reiteradas por el Ejecutivo regional cuando se conoció el PEIT, que mantenía el by-pass por Aljucén.