La creación de la Conferencia de Presidentes, un lugar de encuentro entre las comunidades autónomas y el Gobierno, surgió de un compromiso del presidente del Gobierno, José Luis Rodríguez Zapatero, el día del Debate de Investidura en marzo del 2004, donde la definió como "un complemento idóneo de un Senado reformado". Sin embargo, ya en septiembre de 1994 se aprobó una moción --propuesta por el PP-- en el pleno del Senado en la que se pedía al Gobierno que constituyera una Conferencia de Presidentes con el objetivo de discutir asuntos generales que incidieran en el ámbito de las comunidades.
A pesar del visto bueno del Senado a la creación de esta Cumbre autonómica, el Gobierno del PP no la convocó en ninguna de sus Legislaturas. Siete meses más tarde del anuncio de Zapatero, se convocó la primera Conferencia de Presidentes el 28 de octubre del 2004.
