La Junta y el Gobierno han aplicado diversos baremos sobre la ejecución del PHN.
El ejemplo más claro tuvo lugar el año pasado, cuando la ministra de Medio Ambiente, Cristina Narbona, afirmó que ya se habían comprometido el 49% de las actuaciones. Esto situaba a la región como la tercera con mayor cumplimiento. Al día siguiente Rodríguez Ibarra afirmó que sólo se había certificado el 10% del presupuesto, 19 puntos por debajo de la media nacional.
Tras el Consejo de Ministros de Mérida Ibarra afirmó que en estos momentos el grado de ejecución es ya del 44%.
