El fiscal jefe de la Audiencia Nacional, Javier Zaragoza, explica en su informe que el auge del terrorismo islamista "parece incontenible". A su juicio, la integración de los grupos salafistas magrebís en Al Qaeda a comienzos del 2007, la proximidad geográfica con Marruecos y el Magreb, la existencia de campos de entrenamiento en el Sáhara, las amenazas de Al Qaeda contra España y el juicio del 11-M son "factores que han incrementado el riesgo de la amenaza en nuestro país". Por ello, defiende un aumento de la cooperación internacional y la aplicación preventiva de la ley.
Durante el 2006 fueron detenidos 56 presuntos islamistas. Hasta abril, estaban en prisión 143 personas acusadas de pertenecer o colaborar con el terrorismo internacional, 93 por ser de Al Qaeda, 32 del GIA, 11 de Ansar al Islam, 10 de los Grupos Salafistas para la Predicación y el Combate, uno de Hamás y un checheno. La fiscalía ha presentado ocho escritos de acusación contra 64 personas. En ese periodo ha habido 4 juicios contra 10 personas y en tres sentencias dictadas que condenan a dos personas por colaborar con el atentado en Djerba (Túnez). Uno de los acusados ha sido absuelto.
