DO Queso de La Serena fue creada en 1991 coincidiendo en la Feria Nacional del Queso de Trujillo. En 1992 se aprobó el reglamento de la denominación y su consejo regulador, aprobado posteriormente por el Ministerio de Agricultura. Esta D.O. goza del calificativo de "protegida" desde 1996, por lo que fue pionera en la región.

La Junta reconoció en 1999 la denominación de origen Torta del Casar. Dos años después se aprobó el reglamento por el Ministerio de Agricultura y fue ratificado por la Comisión Europea. En 2003, se inscribió la Denominación de Origen Torta del Casar en el registro.

En el 2005 le llegó a la DOP Queso Ibores el reconocimiento y la protección de los organismos de la UE en un proceso que comenzó en 1994 con una concesión provisional de D.O. El reglamento se aprobó en 1997 y en el 2004 obtuvo la protección nacional.